Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKACBP22694 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms