Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PTPRAP18433 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PTPRAP18433 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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