Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GNB3P16520 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GNB3P16520 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GNB3P16520 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GNB3P16520 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GNB3P16520 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GNB3P16520 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GNB3P16520 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GNB3P16520 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GNB3P16520 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GNB3P16520 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GNB3P16520 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GNB3P16520 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GNB3P16520 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
GNB3P16520 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms