Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GABRA1P14867 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms