Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RARBP10826 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RARBP10826 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RARBP10826 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RARBP10826 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RARBP10826 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RARBP10826 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RARBP10826 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
RARBP10826 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RARBP10826 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RARBP10826 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RARBP10826 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms