Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX5BP10606 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX5BP10606 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COX5BP10606 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COX5BP10606 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms