Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCL3P10147 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CCL3P10147 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL3P10147 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL3P10147 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CCL3P10147 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3P10147 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3P10147 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3P10147 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3P10147 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3P10147 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3P10147 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3P10147 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3P10147 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3P10147 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3P10147 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCL3P10147 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms