Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMIGD3P0DMS9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms