Protein–RNA interactions for Protein: P0CK97

SLC35E2, Solute carrier family 35 member E2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2P0CK97 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SLC35E2P0CK97 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms