Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSF3P09919 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSF3P09919 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSF3P09919 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3P09919 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3P09919 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3P09919 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSF3P09919 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms