Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RHOP08100 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOP08100 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOP08100 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOP08100 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOP08100 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOP08100 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOP08100 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOP08100 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOP08100 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOP08100 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOP08100 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RHOP08100 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RHOP08100 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RHOP08100 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RHOP08100 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms