Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NEFLP07196 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NEFLP07196 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NEFLP07196 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NEFLP07196 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NEFLP07196 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms