Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HLA-DQB1P01920 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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