Protein–RNA interactions for Protein: P01876

IGHA1, Immunoglobulin heavy constant alpha 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHA1P01876 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGHA1P01876 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGHA1P01876 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms