Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYF2O95926 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYF2O95926 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYF2O95926 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYF2O95926 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYF2O95926 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYF2O95926 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYF2O95926 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYF2O95926 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYF2O95926 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SYF2O95926 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYF2O95926 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYF2O95926 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYF2O95926 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYF2O95926 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYF2O95926 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYF2O95926 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYF2O95926 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYF2O95926 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms