Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SNX4O95219 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SNX4O95219 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SNX4O95219 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX4O95219 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX4O95219 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX4O95219 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX4O95219 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SNX4O95219 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms