Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCATO75600 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCATO75600 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCATO75600 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCATO75600 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCATO75600 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCATO75600 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GCATO75600 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms