Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms