Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMARCA5O60264 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms