Protein–RNA interactions for Protein: O60220

TIMM8A, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim8 A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM8AO60220 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM8AO60220 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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