Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SYNGR3O43761 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms