Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM6AO15550 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KDM6AO15550 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms