Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms