Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PCH4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PCH4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PCH4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PCH4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PCH4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PCH4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PCH4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
E9PCH4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
E9PCH4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
E9PCH4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PCH4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PCH4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PCH4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PCH4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PCH4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PCH4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PCH4 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PCH4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PCH4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PCH4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PCH4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
E9PCH4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
E9PCH4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
E9PCH4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
E9PCH4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
E9PCH4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
E9PCH4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
E9PCH4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
E9PCH4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
E9PCH4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
E9PCH4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
E9PCH4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
E9PCH4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PCH4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PCH4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
E9PCH4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms