Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
STRCP1A6NGW2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCP1A6NGW2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCP1A6NGW2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCP1A6NGW2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCP1A6NGW2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCP1A6NGW2 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCP1A6NGW2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCP1A6NGW2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCP1A6NGW2 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCP1A6NGW2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCP1A6NGW2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
STRCP1A6NGW2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
STRCP1A6NGW2 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms