Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLHL33A6NCF5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL33A6NCF5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms