Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms