Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNX8Q9Y5X2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNX8Q9Y5X2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms