Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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SNX13Q9Y5W8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNX13Q9Y5W8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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