Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
THRAP3Q9Y2W1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
THRAP3Q9Y2W1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms