Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CHKBQ9Y259 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHKBQ9Y259 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms