Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC2Q9Y235 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms