Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP2

IQSEC3, IQ motif and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQSEC3Q9UPP2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IQSEC3Q9UPP2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IQSEC3Q9UPP2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms