Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TNFSF18Q9UNG2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms