Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNX12Q9UMY4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms