Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
INO80Q9ULG1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms