Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
TRAPPC2LQ9UL33 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms