Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MRTO4Q9UKD2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms