Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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