Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCN11AQ9UI33 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms