Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TRPS1Q9UHF7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms