Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHORDC1Q9UHD1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms