Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
COPS7AQ9UBW8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
COPS7AQ9UBW8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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