Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SPASTQ9UBP0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SPASTQ9UBP0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms