Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
REREQ9P2R6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
REREQ9P2R6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
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