Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KLHL13Q9P2N7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms