Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HOMER3Q9NSC5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HOMER3Q9NSC5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms