Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RASSF1Q9NS23 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASSF1Q9NS23 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms