Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TMPRSS4Q9NRS4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms