Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LHX9Q9NQ69 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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LHX9Q9NQ69 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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